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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿控制系统软件常用见的疫情组成。肾集体中CaOx尖晶石过是处于饱和状态堆积会引发肾小管细胞核板材损害和凋亡,故而引发肾结石的生成。短链乳酸酸由肠胃内厌氧反应器有害菌厌氧发酵伙食纤维棉呈现,不在高斯模糊肠胃防御控制系统中挥发功效功效,所以在控制系统软件程度上也挥发功效根本功效。在其中,丁酸是最雄厚的短链乳酸酸,极具免疫细胞遏制和免疫细胞遏制功效,本研究分析浅谈丁酸对CaOx肾结石的功效下列不属于隐性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗泌尿五官科吴忠教援、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了互联网药理学学安全服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子名号:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 买家厂家:华山专科医院 探析人:大鼠、HK-2细胞系 分类问题:对比组(Con)、模式化组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱供应技术应用:数据网络药剂学学探测

总体目标步骤图

探索效果

设计人群先是勾勒大鼠实体模形,完成人体生理血生化指数和机构疾病学上色等设计方法会发现丁酸能否少CaOx实体模形大鼠肾CaOx尖晶石的产生和损害,促进CaOx实体模形大鼠的感染损害和防阳极氧化有害物质的过渡传达。然而,丁酸还可阻止草酸分析的HK-2細胞损害、防阳极氧化应激性和細胞凋亡。 为蜡烛燃烧实验丁酸的框架和靶dna电脑数据网,研发涉及到人员从PubChem读取丁酸和丁酸酯的二维和三维立体的框架(图1A)。在PharmMapper大大数据表格库和Uniprot大大数据表格库除理后共建立出115个丁酸靶dna供进两步定性阐述。将dna列表框带到STRING大大数据表格库,做PPI电脑数据网定性阐述。Cytoscape拿出了排名的前20的交通交通交通交通枢纽站靶dna的简单电脑数据网图,例如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。以下交通交通交通交通枢纽站dna与电脑数据网中的一些dna均表达出需要的涉及到性,反映以下dna应该利用着协同管理角色。GO和KEGG定性阐述蕴含了丁酸交通交通交通交通枢纽站dna的涉及到路径和海洋生命科学功用(图1C)。交通交通交通交通枢纽站dna通常与类固醇雌缴素回复、硫化物应激状态性回复、怪物氧上皮细胞对类固醇雌缴素畅快的影响并且对咸性化学上的物质的影响相关。上述情况归结,以下交通交通交通交通枢纽站dna通常参与性了硫化物应激状态性和对怪物氧的海洋怪物影响阶段,是肾结石确立体系中至关首要的路径,这反映丁酸应该在肾结石中利用首要角色。

图1| 丁酸结构设计与靶表观遗传微信网络讲解(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步探秘丁酸对CaOx肾结石真是切靶什么是染色体,研发探讨考生利用率GEO数值库对GSE73680中卫生较与CaOx肾结石用户的什么是染色体地域差异开展了研发探讨。较组与CaOx结石用户的取得性地域差异表示出来什么是染色体(DEGs)塞查规则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个什么是染色体出现取得变动,这其中3379个(89.4%)什么是染色体表示出来上浮,404个(10.6%)什么是染色体表示出来调低(图2A)。对DEGs开展聚类分析法分析一下法分析一下,热图呈现了前10个被选中DEGs的二维分块聚类分析法分析一下法的特征(图2B)。随着,研发探讨考生利用GeneCards数值库机器鉴定结论了370个或者与CaOx肾结石相应的什么是染色体,关键因素词排名前20位的预测分析什么是染色体和相应性评价长为2C右图。要查找丁酸手术治疗CaOx肾结石的关键因素靶点,研发探讨考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应什么是染色体处里能够一个Venn图。结果,CYP2C9被敲定为丁酸影向CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。除此之外,研发探讨考生还开展了丁酸与CYP2C9的碳原子无缝对接,CYP2C9的以下三个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸上下级反应,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用率网临床药理学预侧CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶表观遗传后,钻研考生还能够组织测试声明了CYP2C9可减小草酸诱导型的HK-2组织的ROS含量、支原体感染挤压伤和凋亡。

图2| 半数以上据库合力分享分析CYP2C9是丁酸影响于CaOx肾结石的靶基因遗传

深入分析最终

本分析第一出现 丁酸在身体和人体均能控制CaOx肾结石对模型的防氧化反应应激状态性和发炎软组织伤到,继而能够系统临床药剂学学需求得到了丁酸印象CaOx肾结石的存在靶点——CYP2C9,第三能够神经元实验英文声明CYP2C9在草酸盐诱惑的HK-2神经元ROS水平方向、发炎软组织伤到和凋亡。这部分出现 体现了丁酸可以能够控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的防氧化反应应激状态性,降低发炎软组织伤到。哪一工作中拜谱海洋生物学具备了系统临床药剂学学技艺服务质量管理,凡此种种拜谱海洋生物学可加强稳重建全的表观遗传组学、蛋清质组学、基础代谢组学等两组学的产品及技艺服务质量管理,欢迎词致电的方式谘询! 选取期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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