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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已显现出丰富的生物工程活性酶类，涵盖抗癌症和抵抗毒功用。经常，三萜是采用甲羟戊酸方式合并的，并从当然草木和病菌中导入。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊出了发表文章“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探讨分析文章。该探讨分析看见三萜类类化合物野生灵芝粉酸（GA）是使用溶液培养出的无柄野生灵芝粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的菌物体图片转换生成的。能够转录组和蛋清质组学高高技术进的一步深入研究无柄虫草粉菌丝体中DHT生成三种虫草粉酸（GA）的原则，并要根据多个学高高技术检侧到的差别的基因遗传和差别的蛋清，猜测DHT 菌物体获得 GA 的条件。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录多组分析和技能分类管理

能够对无柄虫草白色念珠菌菌丝体做好转录组测序共取到67230个转录本和14299个单dna组遗传。在许多单dna组遗传中，491个被判定为差异性呈现dna组遗传（DEGs），表中213个呈现上浮，279个呈现降低（图1A）。GO动物丰度讲解后，DEGs可分动物阶段（BP）、人体神经元材料（CC）和分子式系统（MF）3类。在BP种类中，冒出了前6个子种类：四环素转换基础神经元消化吸收阶段，冰醋酸盐基础神经元消化吸收阶段和甲酸盐基础神经元消化吸收阶段;而在CC种类中，人体神经元外区、突触黏结体、突触构造是前6个亚类。相对 MF种类，甲酸脱氢酶（NAD）活力性、防氧化恢复备份酶活力性和酸氨（或酰胺）连入酶活力性是前6个亚种类（图1B）。在DEGs的KEGG表现环路讲解中，前30条动物丰度度最底的表现环路有27条是基础神经元消化吸收，表中丁烷基础神经元消化吸收、乙醛酸盐和二羧酸盐基础神经元消化吸收、丙酸盐基础神经元消化吸收表现表现环路特殊动物丰度（图1D）。

图1|转录混合物析和用途分类别

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

用对无柄虫草真菌孢子菌丝体实现球膳食纤维组学讲解，总计有制定了16,457种特有肽、2606种球膳食纤维和2588种降钙素原检测球膳食纤维。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的建立的条件下，这2606种球膳食纤维中，94种被技术鉴定为区别表述球蛋清（DEPs），这之中52种上浮，42种上涨（图2A），图2C屏幕上体现了区别表述球蛋清的聚类算法讲解热图。从GO讲解你看，BP类型屏幕上体现，基本上数DEPs用乙酸盐吸附神经神经元核产生转化进程、消炎药吸附吸附神经神经元核产生转化进程和药物剂量吸附吸附神经神经元核产生转化进程。CC类DEPs在神经神经元核外区、过空气氮化合物酶体和微体中占到正比极高，空气腐蚀重置酶渗透性和甲酸脱氢酶（NAD）渗透性在MF类中DEPs的正比极高（图2B）。与转录组最终相同，KEGG统计数据径路讲解屏幕上体现，一些DEPs在吸附神经神经元核产生转化中丰度，这之中3条最丰度的途经是光合生物制品技术中的碳不变、碳吸附神经神经元核产生转化和MAPK统计数据统计数据径路（图2D）。还有，用讲解GO统计db2数据库的CC对DEPs实现亚神经神经元核标记讲解和批注（图2E），DEPs核心规划在神经神经元核质（40.66%）、神经神经元核膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），概念上是GAs生物制品技术制成的核心区域。

图2|球脂肪酸组的降钙素原检测剖析和功用证实

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

过活物导出和比组侯选人DEGs和DEPs生产制作了维恩图，有20个差别的体现出dna（图3A）。对转录组和淀粉酶质组中E组和C组分为的DEGs/DEPs通过聚类定量深入分析定量深入分析，发觉mRNA和淀粉酶质中间有18个调整dna和8个下跌dna，DEGs两者之間泰语翻译的DEPs体现出水准呈正有关系，基本概念Pearson的有关系弹性系数定量深入分析，在转录组和淀粉酶质组中间判断到对应较高的有关系性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）论文检测最终結果表明，E组和C组14个DEGs的表明技术的差异强势，但其中9个为上涨DEGs，3个为下降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的表明趋向与转录成分析最终結果一样。

图3|球营养素组的化学发光法探讨和模块验正

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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