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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体外来物种特喜欢的人、寡核苷酸体现代价高价或控制步骤流程繁多。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯专家教授管理团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个降低成本费、跨植物物种、全软件兼容的全新解决方案。

刊物详细介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内现代有效院基因病与骨骼发育微生态学制品学学习所和国内现代基因病直到学会举办的国际联盟学术研究性刊物,锐意创新于简讯寿命有效和中医学基因病学这个科技层面的原创视频性学习成效。JGG 2028年度影响到指数7.1,Scopus学术研究性刊物测评依据CiteScore 9.9,跃居JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY这个科技层面Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY这个科技层面Q1区,跃居国内现代有效院刊物区分微生态学制品学种类别1区(Top刊物),基因病学和生化学与大分子微生态学制品学小类双1区。

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什么样是HEATag

完美的“二合为一体”设计的概念

HEATag是由凝集素和HUH内切酶搭建的整合蛋白酶

「精确定位器」模组 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化呈现(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「链接器」模快 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数条型码进行共价拼接。

“1+1>2”的实际效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行子样本符号与朔源。

Fig1: HEATag众多标上目的举手图

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实际质量检验

HEATag无论有多用打?

不错在不同的状态下,保持辅乳期绿色组织体细胞系单组织体细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研究方案团队协作为 HEATag 配置了多轮 “重压测试英文”,从生殖内部系到生殖内部核,从恒温的到低温制冷的效果,从新鲜样品量到规定样品量,全座向认证它的固相关性和稳定性。

一是轮检验造成乳期动物界受损上皮神经细胞系:科研职工选定了存在人、鼠、仓鼠这三个动物群的多种受损上皮神经细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在环境温度下能 HEATag 箭头后混合式测序。终结的回收利用的 11447 个受损上皮神经细胞中,85.66% 都能可以通过 HEATag 条状码更准确符合到原动物群,样本量间穿插被污染较少,UMAP 聚类浅析法浅析更为间接表明,HEATag 条状码与动物群炎症因子朋友DNA组表现程度不符。 随后,检验前提进一歩升极:科学研究有关的人员试穿在 4℃下元素丰富的肿瘤癌人体细胞系核、在室内温度下元素甲醇调整肿瘤癌人体细胞系核,或者同时元素肿瘤癌人体细胞系核核。效果依旧显眼:每个前提下,样版元素与动物群信心均具很好的的有关的性,分割精确性率超 95%。纵然甲醇调整会出现不严重的转录本交差严重污染,肿瘤癌人体细胞系核核制得会起几瓶 RNA 泄露,肿瘤癌人体细胞系核业务类型的注解效果依旧与丰富的样版保持良好相同,验证 HEATag 能元素各种净化处理前提下的科学实验样版。

Fig2: HEATag 可在的不同经济条件下成功单细胞膜转录组混样浅析

够标记图片辅乳期哺乳甲壳动物和海上无脊椎骨哺乳甲壳动物的原代上皮细胞

如果你癌体细胞系测试测试是 “基本题”,那安排模板便是 “额外添加题”, 这一些模板总是因癌体细胞类型的复杂性、工作环境适用性特出,拥有符号方法的 “常见问题”,而 HEATag 正好在这一些 “常见问题” 上能够了优点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团队,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不单单能被精确度识别,因此关键体细胞性质的聚类分析結果都明确可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋资源菌物的兼容性测试性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长条码与种群转录组更具较高同一性,沒有发生因高盐场景影响的 “标示不能正常工作”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可实现目标辅乳期甲壳动物集体样版多沉 scRNA-seq 定量分析

Fig4: HEATag可达成清爽海域无脊柱昆虫诸多 scRNA-seq 阐述

HEATag与组织的相结合不容易激发转录组的明显变更

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在来完成标记符号神器任务的还,不要对随后的转录酚类化合物析引致要素,担保了研发数剧的真性。

Fig5: HEATag并不会干扰子样本的 RNA 把你想表达出来模式英文

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的前景可期

HEATag 能为单血细胞的研究造成这些?

HEATag 的实际价值,远不是于 “处理标注困难”,它的轻松性和普遍意义,请稍等为单细胞核调查点开其他机会性

从应用软件的场景方面看

HEATag 能铺盖从 “简便很概述”(如癌组织结构组织开展化与很正常组织结构组织开展化、中成药正确处理与参考)到 “青岛浒苔化分析”(如组织结构组织开展化神经元核图谱画制、高通骁龙量建立)的全范畴要。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等当下可延伸技术性的成长 ,HEATag 还能进一步的骤增强单神经元核分析的通量,助推器成果转化技术团队组织开展更青岛浒苔化的内容。

从跨教育领域升值空间看看

HEATag 不单适于于转录组学,还能与表观表观遗传组学、淀粉酶质组学、服务器组学等方法性结合起来,经过制作检索和寡核苷酸队列,HEATag 应该愉快加入差异的组学流程图,不应响预警截获角度。同时,应用于HEATag还应该快速发展单肿瘤细胞糖组学学习方法性。

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联合的动态

拜谱动物与陈凯传授制定开始合作方式意向书

引起加关注的是,在 HEATag 系统创造出庞然大物APP优势的后台下,拜谱怪物已与华南地区海洋怪物环境科学学与建筑工程惠州市实践性室(深圳)陈凯教学完成率最初始企业合作想法。当事人计划书围绕着 HEATag 系统的加工业化半空、教学科技创新变为等的方向进行深浅优势互补,促进推动相应高产出预算、跨种类的单内部图标系统很快APP于现实教学科技创新画面,为越多实践性室供给高效能、国家经济的单内部实验生产工具,帮助教学科技创新事情者在内部怪物学、海洋怪物环境怪物学、病症长效机制等区域有越多挑战
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