
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
分析没想到
设计员探索渐渐冷冻箱时候增长牛羊肉的抗拉强度、持混流式水轮机、汤色、徘徊铁含氧量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4级别来考评肌肉团体团体上皮肿瘤细胞的铁去世的情况。结论出现,冷冻箱时候增长后,牛羊肉的抗拉强度在第3天和第6天同质性减少;持水力降低了;红颜色变深,抛弃有光泽度,鲜色转成暗色。然而,徘徊铁、生物氧和MDA的含氧量同质性曾加,上皮肿瘤细胞凋亡率同质性提升。 研究剖析职工取出不相同要在冷藏室保存时刻的肌群群图纸的蛋清质,其次进行SDS-PAGE剖析,蛋清质条带在不相同期间匀称不光滑且相同(图1a)。随着蛋清在不相同图纸中的理解状况,剖析发展一模一样组图纸的中六位数比较接近于于一模一样水准(图1b),情况说明肌群群图纸蛋清质享有比较好的组内相同性和组间区别性。 球氨基酸组学共评定出1996种球氨基酸。以B0为比组,淘汰B1、B2、B4和B6中的球球核球蛋白酶开展对比传达阐述,共评定到37几个DEPs。将火山图可视化数据,并可根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位规格阐述DEP。后果就像文中1c-f已知,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别评定出22、33、73和140个DEPs,这其中分头别上浮6、11、32和84个,下跌16、22、41和58个。聚类分析法办法开展了各个冷冻冷藏第一阶段背部肌肉组织安排组织安排中球氨基酸的传达,后果提示 背部肌肉组织安排球球核球蛋白酶传达对比发生变化放置的时间的增大而增大(图1g)。
图1| 有差异 保鲜冷库精力的脂肪合格品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同的冷藏箱准确时间的肌群样机地域差异淀粉酶定性分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁去世核蛋白肽的PRM一定量定量分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG聚集相互影响展现球蛋白的铁阵亡缘由(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT参考值蛋清酶质组学技术设备应用保障质量,拜谱生物技术设备已研制成功完成并建立起了健全稳定的转录组学、蛋清酶组学、分解代谢组学、两组学聯合好产品技术设备应用保障质量管理体系,欢迎致电咨询!
参照论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.